分子生物學實驗室常用的儀器設備包括PCR儀、凝膠電泳儀、雙向電泳分析系統、多功能酶標儀、熒光定量PCR儀、電轉化儀、小型多功能高速離心機、勻漿儀、微量核酸蛋白分析儀、恒溫培養箱、恒溫培養振蕩器、層析冷柜、半干轉FP系統、通風柜、電熱（恒溫）鼓風干燥箱、電熱恒溫水浴鍋、超聲波破碎儀探頭、電子天平、微量移蛋白質分析平臺等。

此外，根據不同的實驗需求，還可能需要其他特定的設備，例如光學顯微鏡、掃描顯微鏡、均質器等。

這些設備需要定期維護和校準，以確保其準確性和可靠性。同時，實驗室工作人員需要遵循安全操作規程，正確使用和存放這些設備，以確保實驗結果的準確性和實驗室的安全。